Als Prototyp wird das erste Raumschiff einer Klasse bezeichnet. Da ein Prototyp oft Träger neuer Technologien ist, stellt deren Erprobung ein wichtiger Bestandteil der Aufgaben eines solchen Schiffs nach dem Stapellauf dar. In dieser frühen Nutzungsphase trägt die Registriernummer des Schiffs meist den Präfix NX statt NCC.
Für gewöhnlich sind Schiffsklassen der Sternenflotte nach dem Prototypen benannt.